博士班(96年度)
| 海運學院
| | 海洋法律研究所博士班 | 國際法(含國際海洋法,海洋行政法規暨海事私法) 法學英文
| | 航運管理學系博士班 | 航運總論(海,空運) 統計學 文獻評論
| | 生命與資源科學院
| | 環漁系博士班 | 環境生物與漁業科學綜論(甲組)
經濟理論與數量方法綜論(乙組)
| | 食科系博士班 | 食品科學綜論
| | 水產養殖學系 | 水產養殖學綜論
| | 海洋生物研究所博士班 | 海洋生物學綜論
| | 理學院
| | 應用地球科學研究所 | 地球科學綜論
| | 工學院
| | 系統工程暨造船學系 | 工程數學
| | 河海工程學系 | 大地工程組:都市及土木計劃綜論 運輸規劃綜論 大地工程綜論
結構工程組:結構材料綜論
海洋工程組:海洋工程綜論
水資源與環境工程組:水資源工程綜論
| | 材料工程研究所博士班 | 營建材料組:營建材料學導論 工程力學
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